2021年3月2日发布的《关于发布〈深圳证券交易所债券质押式协议回购交易业务办法〉的通知》对债券质押式协议回购业务进行优化，并同步修订了《深圳证券交易所债券质押式协议回购交易主协议》，形成《深圳证券交易所债券质押式协议回购交易主协议（2021年版）》（以下简称《主协议（2021版）》）。《主协议（2021版）》自2021年5月17日起生效。

为保证新旧协议的平稳过渡，2021年5月17日至2021年11月16日为《主协议（2021版）》实施的过渡期。过渡期内，未签署《主协议（2021版）》的市场参与人，仍可开展协议回购交易，并由回购双方协商约定继续适用原签署的主协议或适用《主协议（2021版）》。过渡期结束后，仍未签署《主协议（2021版）》的市场参与人，不得开展新的协议回购交易。市场参与人应在过渡期内积极协商沟通，尽快签署《主协议（2021版）》并完成备案，《主协议（2021版）》备案采用电子化方式进行。